能源平衡表和投入产出表两者在共同表征的关系上总是无法做到一致，这主要是由于：
① 编制原理与复杂程度不同。投入产出表的编制涉及所有部门，其间关系都必须兼顾，复杂程度高于能源统计。
②统计口径与调查范围存在差异。投入产出表编制的调查范围仅限于重点企业，而能源平衡表的统计对象几乎涵盖了全部企业。
③数据的可得性与数据质量不同。能源平衡表是以实物量或者热值当量为单位衡量能源的生产与消费，而常用的价值型投入产出表涉及产品的价格，价格的波动与多样性会使投入产出表的数据质量下降。这些在一定程度上影响着模型功能的发挥与结果的可信度。
